双链酶可作为辅助药物用于治疗脓胸、血胸、血肿、引流窦的慢性化脓、骨髓炎、溃疡和感染性创伤。亦用于眼前房出血及玻璃体积血。但是，腔内注射可引起发热和出血。发热可用糖皮质激至少治疗。出血用6-氨基已酸有效。本品办是一种辅助治疗药物。只能在抗菌治疗和外科清创、引流等基础上应用。本品禁用于急性化脓性峰窝组织炎、活动性肺结核及支气管胸膜瘘病人，以免病灶扩散。低纤维酶原、低纤维蛋白原及肝功能、血象异常者亦均禁用。
本品可于患部腔内注射，或局部外用。腔内注射，对血胸和脓胸，可用10万单位SK和5万单位SD溶于10ml以上生理盐水注入。对上颌窦积脓，可注射1万～1.5万单位的SK和5000～7500单位SD（溶于2～3ml生理盐水中）。口含，每日4次，每次1 片，连用4～6日，滴用，用1000单位/ml溶液局部滴入，`1～2h1次，局部注射，眼内球后或结膜下注射、病灶周围注射，浓度为1000～2000单位/ml。
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